question: passerelle windows Vs Linux

Voila, j'ai deux PC de hardware différent, avec deux OS différents.

Un PC qui tourne sous win2000 pro, SP2:
Athlon 3000+,
512 mb DDR
HD 40Go Maxtor
lecteur DVD LG
TNTII
carte mere MSI KT7

un PC qui tourne sous slackware 8.0
Celeron 800
512 Mb
HD 40 Go Maxtor
lecteur DVD LG
G4 MX
carte mere MSI je-sais-pas-trop-quoi

Bref, au vu des configs, le premier Pc est sensiblement plus performant.

Les deux m'ont servi de passerelle avec un modem Alcatel USB (la vieille raie),
aucun programme n'est installé a part: la mule (les deux Pcs), Zonealarm (Windows), Norton AV (Windows),
Brandwith limiter (Windows) - linux faisant le reste deja avec l'install de base; 3 servers CS 1.6 (linux) et Ksirc sur linux aussi.
SMB a été installé sur le linux car il fait office de server de fichiers en plus de la passerelle. Le partage de fichiers est configuré sous windows, et j'ai forcé la swap a 758 Mb sur une partition a part en FAT32 pour windows. Le C: est en NTFS, et le HD n'est utilisé qu'a concurrence de 3 Go.
Les deux Pcs sont équipés de VNC server.

Apres deux mois d'uptime non stop,
pas de probleme pour le Linux, mais par contre mon windows semble de plus en plus lent...et ce meme au démarrage (oui, j'ai du réinstaller l'antivirus récemment, il a foiré sa mise à jour). Deja au bout d'un mois, il me semblait que ne fut ce que pour ouvrir une fenetre DOS, il mettait un certain temps...
Ais-je oublié une option ou un paramétrage de windows? Je dois le garder pour au-cas-ou-le-Pc-de-jeu a un probleme et que je puisse jouer au cas ou. Puis bon...avec les server CS, Smb, le linux devrait trainer a mort, mais c'est pas vraiment le cas. J'ose meme pas installer Msn sur le windows tellement il est lent!

Bref, le 2000 pro est-il fait pour un uptime moyen?

edit: il va de soit que le HD windows est régulierement défragmenté au-cas-ou; et que aucun virus n'est présent.