En solution temporaire, tu peux toujours installer manuellement les màj en allant dans le dossier C:\WINDOWS\SoftwareDistribution\Download .
Tu y trouveras plusieurs dossiers (1 dossier par maj), donc fais un tri par date pour trouver les dernières maj téléchargées.
A l'interieur de l'un de ces sous-dossiers, il y a un dossier qui s'apelle "update" et à l'intérieur de ce dernier se trouve un update.exe que tu peux executer sans crainte.
De cette manière l'installation n'échouera plus.
Bon, si y a des tonnes de màj, la procédure devient vite gavante et il existe des FIX qui pourront peut-être solutionner ton problème mais faut que je remette la main dessus.
(j'ai eu un soucis similaire apres une reparation de windows donc reinstallation sur un windows existant, un peu comme ce que tu as fait : installer un windows sur un autre windows)
EDIT : voici un FIX en question :
http://wiki.djlizard.net/Dial-a-fix
tu coches juste FIX Windows Update et ensuite Go